Čunovské jazerá sa nachádzajú v oblasti chránenej prírody, platí tam štvrtý stupeň ochrany. Za kúpanie v nich preto môžete dostať pokutu do výšky temer 10-tisíc eur.
Zákaz platí z dôvodu ochrany prírody, nie vodného zdroja. Samotné kúpania sa v jazerách totiž neovplyvňuje kvalitu podzemnej vody. Jazerá sa nachádzajú na území prírodnej rezervácie Ostrovné lúčky, kde platí štvrtý stupeň ochrany, a chránenom vtáčom území Dunajské luhy.
Donedávna sa návštevníci mohli kúpať vo vyhradenej oblasti, nerešpektovali však nariadenia a jazdili autami do bezprostrednej blízkosti jazier a kúpali sa na celom ich území. Ničili tak faunu aj flóru a zanechávali po sebe množstvo smetí.
